70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2594 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  100 
 
 
320 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  42.6 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  35.48 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.98 
 
 
330 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  32.88 
 
 
288 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  34.71 
 
 
337 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  31.94 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  31.6 
 
 
594 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  31.71 
 
 
268 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  30.79 
 
 
329 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  30.79 
 
 
329 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.83 
 
 
349 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  30.96 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  28.05 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  28.05 
 
 
309 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  30.58 
 
 
307 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 
597 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  28.19 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.48 
 
 
617 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.56 
 
 
418 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  27.72 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  27.7 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.66 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  29.93 
 
 
647 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.23 
 
 
628 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  24.42 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 
630 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  26.92 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 
658 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  28.66 
 
 
628 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  25.41 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  24.91 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  24.68 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.21 
 
 
607 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  26.97 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  30.92 
 
 
584 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  28.94 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  27.42 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  27.02 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  29.39 
 
 
640 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  23.79 
 
 
433 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  28.25 
 
 
646 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  30.43 
 
 
656 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.97 
 
 
629 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  23.47 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  28.19 
 
 
646 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  29.95 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  31.4 
 
 
656 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  28.18 
 
 
662 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.7 
 
 
538 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  29.34 
 
 
640 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  27.02 
 
 
636 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0298  hypothetical protein  28.77 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784085  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.4 
 
 
723 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  25.68 
 
 
663 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1678  hypothetical protein  26.09 
 
 
390 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09442  cellulose-binding GDSL lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00510)  24.71 
 
 
248 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  25.23 
 
 
340 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.58 
 
 
375 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25 
 
 
375 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  25.73 
 
 
629 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  26.02 
 
 
629 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  26.45 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1696  Phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.96 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  26.42 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.42 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  26.1 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.14 
 
 
379 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>