60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1011 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  100 
 
 
418 aa  876    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  63.99 
 
 
418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  67.63 
 
 
418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.87 
 
 
418 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  43.04 
 
 
454 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  30.22 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  26.74 
 
 
309 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  26.99 
 
 
309 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  27.11 
 
 
284 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  26.49 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  24.91 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  24.91 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.74 
 
 
330 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  26.45 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  24.91 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  24.91 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  24.91 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.8 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  25.83 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  26.04 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  24.3 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0133  GDSL family lipase  24.82 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  24.41 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  23.84 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  25.08 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  23.76 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  26.02 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  25.09 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  25.57 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  24.16 
 
 
307 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  24.28 
 
 
307 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  23.24 
 
 
597 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  23.21 
 
 
597 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.87 
 
 
617 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  22.41 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09442  cellulose-binding GDSL lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00510)  22.27 
 
 
248 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 
658 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  22.07 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 
630 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.66 
 
 
610 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  24.6 
 
 
647 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  22.48 
 
 
504 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  24.66 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  24.57 
 
 
627 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  21.55 
 
 
628 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.08 
 
 
723 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  21.61 
 
 
607 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.54 
 
 
629 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  23.23 
 
 
339 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  24.2 
 
 
340 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  22.26 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  26.67 
 
 
516 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  25.56 
 
 
516 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  22.26 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  20.89 
 
 
538 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>