60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1710 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  100 
 
 
408 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  95.59 
 
 
408 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  95.1 
 
 
408 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  99.51 
 
 
408 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  99.51 
 
 
408 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0133  GDSL family lipase  40.81 
 
 
380 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  29.54 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  29.54 
 
 
309 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  30.15 
 
 
288 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  27.59 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  30.81 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  24.91 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.43 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  26.91 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  23.47 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.61 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  35.34 
 
 
788 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  25.14 
 
 
516 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  36.21 
 
 
322 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  35.34 
 
 
788 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  35.34 
 
 
788 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  25.81 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  35.34 
 
 
322 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  23.66 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  27.12 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  23.93 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  24.86 
 
 
516 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  23.34 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  22.16 
 
 
375 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  23.1 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  23.47 
 
 
594 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.49 
 
 
538 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  25.27 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.47 
 
 
597 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  23.86 
 
 
647 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.14 
 
 
330 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  27.65 
 
 
597 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  25 
 
 
341 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  23.4 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1302  secreted effector protein  29.57 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1960  secreted effector protein  29.57 
 
 
336 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  36.05 
 
 
776 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  22.05 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2143  secreted effector protein  29.2 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0259631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1340  secreted effector protein  29.2 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.187577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1325  secreted effector protein  29.2 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0184375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.28 
 
 
617 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  24.78 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.56 
 
 
723 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  25.31 
 
 
630 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>