15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1340 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1325  secreted effector protein  100 
 
 		 336 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0184375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1340  secreted effector protein  100 
 
 		 336 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1302  secreted effector protein  91.37 
 
 		 336 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1960  secreted effector protein  91.67 
 
 		 336 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2143  secreted effector protein  99.7 
 
 		 336 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0259631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1740  secreted effector protein  27.33 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1559  secreted effector protein  27.01 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1716  secreted effector protein  26.69 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.634988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1719  secreted effector protein  26.37 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231302  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1780  secreted effector protein  26.05 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  30.09 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  30.09 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  30.09 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  30.09 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  29.2 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
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