15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1960 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1325  secreted effector protein  91.67 
 
 		 336 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0184375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1340  secreted effector protein  91.67 
 
 		 336 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.187577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1302  secreted effector protein  98.51 
 
 		 336 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1960  secreted effector protein  100 
 
 		 336 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2143  secreted effector protein  91.96 
 
 		 336 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0259631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1740  secreted effector protein  29.43 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1719  secreted effector protein  27.24 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.231302  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1559  secreted effector protein  29.11 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1716  secreted effector protein  28.8 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.634988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1780  secreted effector protein  26.92 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  30.43 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  31.3 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  30.43 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  29.2 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  29.57 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
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