109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2331 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 330 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  35.76 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  35.76 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  36.87 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  35.76 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  32.04 
 
 		 284 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  35.13 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  34.02 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  33.75 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  32.31 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.77 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  34.33 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  32.66 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 628 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  30.65 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  30.32 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  32 
 
 		 628 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  30.9 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  31.03 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  30.95 
 
 		 647 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  30.6 
 
 		 594 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  31.91 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.72 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.93 
 
 		 418 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 630 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.38 
 
 		 617 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  33.56 
 
 		 658 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  29.73 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  28.32 
 
 		 597 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 597 aa  86.3  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  27.74 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.42 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  27.83 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  26.44 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  29.21 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  28.47 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  30.55 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  26.55 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  26.11 
 
 		 516 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  25.68 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.74 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  30.23 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  27.47 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 629 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  27.15 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.22 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  23.53 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  23.53 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  28.09 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  27.81 
 
 		 629 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 723 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.31 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.31 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  25.51 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  29.45 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.5 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.5 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.5 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 		 610 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.5 
 
 		 610 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  29.13 
 
 		 646 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  29.04 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  25.29 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  25.72 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  28.32 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  26.5 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1678  hypothetical protein  33.66 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  33.84 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.91 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  26.73 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  25.29 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.27 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09442  cellulose-binding GDSL lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00510)  24.22 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  33 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  33 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  25.34 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  25.75 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.92 
 
 		 538 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  26.84 
 
 		 640 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 607 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  25.09 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.2 
 
 		 641 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  24.14 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  24.14 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  26.46 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  24.14 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  24.9 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>