62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2668 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  98.41 
 
 
378 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  100 
 
 
378 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  91.03 
 
 
379 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  91.29 
 
 
379 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  91.29 
 
 
379 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  86.77 
 
 
375 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  83.07 
 
 
375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  75.99 
 
 
379 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  75.99 
 
 
379 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  75.99 
 
 
379 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  75.99 
 
 
379 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  75.73 
 
 
379 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  75.73 
 
 
379 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  75.73 
 
 
379 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  74.67 
 
 
379 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  52.03 
 
 
416 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  53.49 
 
 
393 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  52.02 
 
 
415 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  48.49 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  48.64 
 
 
403 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  47.3 
 
 
340 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  38.69 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  39.14 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  39.62 
 
 
347 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  34.9 
 
 
353 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  34.83 
 
 
647 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.65 
 
 
617 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  29.13 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  30.56 
 
 
594 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  29.97 
 
 
628 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  29.63 
 
 
597 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  30.03 
 
 
597 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  27.9 
 
 
315 aa  92.8  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  30.15 
 
 
630 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  41.52 
 
 
663 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  27.99 
 
 
628 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  27.52 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.62 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  27.38 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  27.08 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  26.73 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  26.43 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.53 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  26.06 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  25.75 
 
 
584 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  25.7 
 
 
377 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  26.2 
 
 
656 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  31.94 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  26.57 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  25.13 
 
 
656 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  25.94 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  22.77 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.07 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  28.14 
 
 
646 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  28.14 
 
 
646 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  26.85 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  23.51 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  26.52 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  24.55 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  23.16 
 
 
319 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  20.77 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 
662 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>