45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0193 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1271    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  42.29 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  41.53 
 
 		 353 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  43.11 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  44.31 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  44.31 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  40.64 
 
 		 347 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  40.64 
 
 		 347 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  35.71 
 
 		 347 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  40.98 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  42.86 
 
 		 375 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  34.48 
 
 		 379 aa  90.5  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  43.21 
 
 		 375 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  31.82 
 
 		 377 aa  87.8  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  42.41 
 
 		 378 aa  87.4  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  43.04 
 
 		 378 aa  87  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  36.99 
 
 		 393 aa  87  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  41.46 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  32.2 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  41.46 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  41.46 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  32.98 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  29.46 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  35.33 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  36.42 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  31.67 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  29.25 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  33.33 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.39 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  28.4 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 597 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  29.56 
 
 		 594 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  26.56 
 
 		 317 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  26.19 
 
 		 628 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  24.87 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3938  hypothetical protein  41.51 
 
 		 180 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.158904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  25.39 
 
 		 317 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  28.66 
 
 		 337 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.3 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>