57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3964 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  100 
 
 
366 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  31.08 
 
 
630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  33.15 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  29.81 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.69 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  31.01 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  30.64 
 
 
379 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  30.64 
 
 
379 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  31.08 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  31.1 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  31.08 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  28.12 
 
 
403 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  29.11 
 
 
375 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  30.9 
 
 
340 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  30.25 
 
 
594 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  29.28 
 
 
628 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.4 
 
 
617 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.33 
 
 
378 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  28.97 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.97 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  28.72 
 
 
416 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.69 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.03 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  30.65 
 
 
647 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  27.33 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 
628 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  27.98 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  28.01 
 
 
597 aa  86.7  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  26.73 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  29.22 
 
 
597 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  28.61 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.15 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  25.7 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  27.3 
 
 
636 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  24.67 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  26.83 
 
 
584 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  26.12 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  27.1 
 
 
656 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  26.83 
 
 
656 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  23.53 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  30.19 
 
 
663 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.78 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  24.94 
 
 
662 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  26.83 
 
 
656 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  25.23 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  29.75 
 
 
429 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  26.1 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  22.19 
 
 
341 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  21.11 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  25 
 
 
640 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  24.19 
 
 
646 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>