84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0580 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  100 
 
 		 347 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  84.77 
 
 		 347 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  84.48 
 
 		 347 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  41.8 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  42.08 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  42.08 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  39.57 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  40.7 
 
 		 375 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  38.57 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  38.51 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  37.71 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  38.42 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  38.76 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  38.78 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  38.44 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  38.44 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  38.46 
 
 		 378 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  38.15 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  35.93 
 
 		 416 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  34.42 
 
 		 647 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  35.77 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  31.59 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  33.66 
 
 		 594 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  32.57 
 
 		 628 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  31.65 
 
 		 630 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.19 
 
 		 617 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  31.08 
 
 		 628 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  37.24 
 
 		 663 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  30.57 
 
 		 597 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  29.3 
 
 		 597 aa  86.3  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  30.89 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  36.36 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.24 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  23.62 
 
 		 309 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  23.62 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.09 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  28.57 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  27.1 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0978  GDSL family lipase  29.71 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  26.77 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  26.89 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  28.37 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.74 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.17 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  30.4 
 
 		 646 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  27.33 
 
 		 636 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  27.71 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  27.71 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0298  hypothetical protein  27.12 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784085  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  29.79 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  26.43 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  27.19 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.7 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  26.97 
 
 		 640 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 		 626 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  24.01 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  25.46 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  39.29 
 
 		 662 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  27.48 
 
 		 629 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 629 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  27.5 
 
 		 629 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  27.33 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  20.77 
 
 		 516 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  27.89 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  26.45 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  28.17 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3938  hypothetical protein  39.42 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.158904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  26.11 
 
 		 640 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  20.92 
 
 		 516 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  21.64 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.71 
 
 		 723 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  23.12 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  21.64 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.3 
 
 		 658 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.27 
 
 		 610 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.27 
 
 		 610 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  23.27 
 
 		 610 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  23.27 
 
 		 610 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  23.27 
 
 		 610 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>