71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1096 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
418 aa  867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  61.35 
 
 
418 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  58.45 
 
 
418 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  52.87 
 
 
418 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  38.1 
 
 
454 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  31.95 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  31.25 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  31.25 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  31.88 
 
 
349 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  28.73 
 
 
284 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  27.21 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  27.45 
 
 
309 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.93 
 
 
330 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  30.6 
 
 
647 aa  89.7  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.34 
 
 
418 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.62 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  27.49 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  27.67 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  26.56 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  29.08 
 
 
594 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  27.34 
 
 
268 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  25.38 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1810  secreted effector protein  24.43 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1710  secreted effector protein  24.43 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133007  normal  0.0148775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1747  secreted effector protein  24.43 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.343873  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  25.25 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.41 
 
 
617 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1750  secreted effector protein  23.74 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0546834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  24.92 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  28.67 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1526  secreted effector protein  24.1 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  27.76 
 
 
658 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0133  GDSL family lipase  25 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.78 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  26.17 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  25.52 
 
 
597 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 
628 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  22.56 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.52 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.52 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.52 
 
 
610 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  28.52 
 
 
610 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  22.22 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 
610 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  26.09 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  25.78 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.33 
 
 
538 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  23.64 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.34 
 
 
326 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  27.46 
 
 
628 aa  56.6  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01792  GDSL Lipase/Acylhydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G14700)  23.1 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.75 
 
 
629 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  27.59 
 
 
636 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 
627 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05930  lysophospholipase A, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10760)  22.75 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0135266  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  23.76 
 
 
372 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 
630 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.1 
 
 
723 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  23.7 
 
 
326 aa  50.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  27.67 
 
 
339 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  27.53 
 
 
646 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  27.53 
 
 
646 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  26.37 
 
 
663 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  23.78 
 
 
504 aa  47.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.62 
 
 
607 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  24.61 
 
 
516 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  24.38 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  23.53 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  26.02 
 
 
429 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>