52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0053 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  100 
 
 
326 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  58.68 
 
 
340 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.1 
 
 
268 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.42 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  24.74 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  24.18 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  25.55 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.46 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  25.09 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  23.51 
 
 
594 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  23.26 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  22.87 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  25.23 
 
 
400 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  22.56 
 
 
326 aa  59.3  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.34 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  24.41 
 
 
454 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  27.93 
 
 
584 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  23.91 
 
 
597 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  24.57 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  22.03 
 
 
309 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  24.12 
 
 
341 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  22.03 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 
597 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  23.28 
 
 
647 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  23.05 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.68 
 
 
628 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  27.37 
 
 
656 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  26.82 
 
 
656 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  23.79 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  21.55 
 
 
433 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  24.2 
 
 
628 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  24.07 
 
 
630 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  21.12 
 
 
433 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.96 
 
 
723 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  21.98 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  24.53 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 
610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.15 
 
 
610 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 
610 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.15 
 
 
610 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.15 
 
 
610 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 
610 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  24.15 
 
 
610 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  21.67 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  21.33 
 
 
340 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  21.26 
 
 
636 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 
617 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  27.93 
 
 
656 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  22.07 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  22.26 
 
 
627 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  24.63 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  23.2 
 
 
372 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>