83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0761 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
629 aa  1272    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  47.69 
 
 
607 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  32.05 
 
 
723 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  29.81 
 
 
684 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  29.08 
 
 
664 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.12 
 
 
641 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  30.05 
 
 
684 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 
658 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  28 
 
 
627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.65 
 
 
610 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.65 
 
 
610 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.65 
 
 
610 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.72 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 
610 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.46 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  26.77 
 
 
594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.46 
 
 
617 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  23.57 
 
 
630 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  23.99 
 
 
629 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 
629 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  23.61 
 
 
626 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  27.97 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  27.97 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  22.66 
 
 
629 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  26.02 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  25.08 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  23.84 
 
 
636 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.81 
 
 
418 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  23.37 
 
 
597 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  23.55 
 
 
597 aa  72  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  26.76 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  28.73 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  26.09 
 
 
763 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  23.4 
 
 
646 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.7 
 
 
759 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  22.89 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  21.69 
 
 
662 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  22.6 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  23.39 
 
 
646 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 
628 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  22.6 
 
 
656 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  24.21 
 
 
349 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  26.71 
 
 
454 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  28.47 
 
 
319 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  24.26 
 
 
337 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.22 
 
 
972 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  22.71 
 
 
628 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.75 
 
 
418 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  24.42 
 
 
284 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  26.3 
 
 
983 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.09 
 
 
1489 aa  55.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  26.32 
 
 
310 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  22.59 
 
 
1222 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  24.82 
 
 
647 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 
1886 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  23.05 
 
 
647 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  25 
 
 
647 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  25.17 
 
 
309 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.17 
 
 
309 aa  51.6  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.18 
 
 
1012 aa  51.2  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  25.54 
 
 
418 aa  50.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.54 
 
 
1769 aa  50.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  28.62 
 
 
320 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 
1369 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 
1078 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  25 
 
 
418 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.38 
 
 
330 aa  47.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  23.53 
 
 
341 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.1 
 
 
1673 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.5 
 
 
602 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  25.5 
 
 
268 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  22.91 
 
 
728 aa  45.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  22.91 
 
 
728 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  22.91 
 
 
728 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  23.33 
 
 
418 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1519 aa  44.3  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  22.42 
 
 
814 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.62 
 
 
910 aa  44.3  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.71 
 
 
915 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.47 
 
 
913 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.7 
 
 
1154 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>