77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3436 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  38.91 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  34.53 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  34.53 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.31 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  32.73 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  32.46 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  32.47 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  31.85 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  31.3 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  31.09 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  31.86 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.92 
 
 		 418 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  31.86 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.88 
 
 		 617 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  31.05 
 
 		 594 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64990  hypothetical protein  29.72 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2065  lipolytic protein  30.93 
 
 		 400 aa  99  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.654891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  31.7 
 
 		 630 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5647  hypothetical protein  29.02 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  30.03 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  29.08 
 
 		 647 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  30.69 
 
 		 628 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  27.04 
 
 		 454 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  28.28 
 
 		 658 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  29.67 
 
 		 597 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 597 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  27.33 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  28.62 
 
 		 628 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  30.16 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  29.14 
 
 		 640 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  29.59 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.41 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  29.31 
 
 		 646 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  29.31 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04871  lipolytic enzyme  26.62 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1011  thermolabile hemolysin  26.35 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000776  thermolabile hemolysin precursor  25.9 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  27.19 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  32 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2749  hypothetical protein  23.51 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2894  hypothetical protein  23.18 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  30.86 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  30.29 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  29.39 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  30.86 
 
 		 656 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  29.07 
 
 		 629 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2313  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  24.72 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0175563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  32.53 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.15 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.9 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1678  hypothetical protein  29.08 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1297  GDSL family lipase  24.92 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.306833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1696  Phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  29.08 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  27.67 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0053  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  25.56 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.687588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  27.67 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  28.71 
 
 		 629 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  24.4 
 
 		 516 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  29.28 
 
 		 627 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 		 626 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.74 
 
 		 610 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.74 
 
 		 610 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.37 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.37 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.37 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  23.92 
 
 		 516 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  24.48 
 
 		 538 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  32.2 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.46 
 
 		 641 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  29.73 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.13 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  28.42 
 
 		 403 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  26.14 
 
 		 723 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  30.16 
 
 		 684 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>