56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2705 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2705  putative lipase / esterase protein  100 
 
 		 429 aa  849    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  35.58 
 
 		 353 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  32.94 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  31.93 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  32 
 
 		 347 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0193  hypothetical protein  43.89 
 
 		 663 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0466  GDSL family lipase  28.67 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0903653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6733  lipolytic protein G-D-S-L family  29.89 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3270  putative lipase / esterase  30.57 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  28.24 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  27.88 
 
 		 375 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  31.98 
 
 		 339 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  35.76 
 
 		 630 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  28.44 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0696  putative lipase / esterase  29.54 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.082644  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  34.44 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  34.44 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  34.44 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6246  hypothetical protein  25.73 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  33.89 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  33.89 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  33.89 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  33.89 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4567  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  30.27 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  26.42 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  26.28 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2621  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.44 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2010  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  26.44 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.66526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3287  lipolytic protein G-D-S-L family  27.38 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.359649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2650  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.2 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  33.08 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.47 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2541  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  25.54 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2668  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  26.02 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.409429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  30.59 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  30.87 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  30.1 
 
 		 597 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  32.93 
 
 		 662 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.25 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  29.8 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  31.21 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  30.97 
 
 		 636 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  27.03 
 
 		 656 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  28.07 
 
 		 288 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  34.62 
 
 		 646 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  30.71 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  33.33 
 
 		 646 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  27.03 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  31.86 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  27.33 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  32 
 
 		 656 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  23.62 
 
 		 284 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.4 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>