91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4606 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  59.09 
 
 		 629 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  57.99 
 
 		 629 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  62.67 
 
 		 636 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  58.08 
 
 		 626 aa  719    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  61.46 
 
 		 646 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 640 aa  1306    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  58.93 
 
 		 629 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  91.72 
 
 		 640 aa  1212    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  61.8 
 
 		 646 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.66 
 
 		 594 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.66 
 
 		 617 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  24.96 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  25.61 
 
 		 628 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.88 
 
 		 597 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 		 662 aa  127  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.56 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  26.59 
 
 		 647 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  25.04 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  24.6 
 
 		 656 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  24.45 
 
 		 656 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  29.78 
 
 		 349 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  25.12 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  22.93 
 
 		 664 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  28.15 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  33.53 
 
 		 288 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.73 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.63 
 
 		 629 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  22.67 
 
 		 684 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  23.18 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  28.66 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.62 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.36 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  25.85 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  25.39 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  26.38 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  28.44 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.32 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  25.08 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  24.2 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  29.25 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  23.97 
 
 		 284 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  27.14 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.39 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  26.76 
 
 		 341 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  27.22 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.47 
 
 		 1028 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.83 
 
 		 774 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  22.99 
 
 		 1012 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.09 
 
 		 347 aa  53.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  25.32 
 
 		 339 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  26.93 
 
 		 353 aa  51.6  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.28 
 
 		 1001 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  24.32 
 
 		 1016 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  24.62 
 
 		 983 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  26.61 
 
 		 1508 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 1011 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  23.83 
 
 		 1677 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.34 
 
 		 1025 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.43 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  24.85 
 
 		 315 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2594  lipolytic protein  28.71 
 
 		 320 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  25.53 
 
 		 379 aa  48.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  28.82 
 
 		 637 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.5 
 
 		 1222 aa  47.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  28.99 
 
 		 1001 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5952  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like  27.22 
 
 		 375 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  20.81 
 
 		 939 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  25 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1678  hypothetical protein  28.93 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  25.48 
 
 		 347 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1096  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.63 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  23.15 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  20.87 
 
 		 972 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  26.42 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0677  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  27.43 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.604763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.63 
 
 		 763 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.7 
 
 		 972 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  25.85 
 
 		 347 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  24.29 
 
 		 366 aa  44.3  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  25.23 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.7 
 
 		 759 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>