49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1537 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.12 
 
 
1842 aa  662    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
3152 aa  6072    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.07 
 
 
3015 aa  736    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.6 
 
 
1953 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.93 
 
 
2302 aa  674    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.12 
 
 
1865 aa  664    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1721  hypothetical protein  65.88 
 
 
86 aa  123  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.508273  hitchhiker  0.00134351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.72 
 
 
1056 aa  69.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  30.1 
 
 
646 aa  66.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.52 
 
 
1156 aa  64.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  29.59 
 
 
646 aa  64.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  29.21 
 
 
1154 aa  61.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.26 
 
 
1508 aa  60.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  28.91 
 
 
1882 aa  59.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  31.93 
 
 
629 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 
759 aa  57.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  23.6 
 
 
983 aa  57  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 
629 aa  56.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.66 
 
 
1179 aa  55.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.57 
 
 
763 aa  55.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.3 
 
 
991 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.68 
 
 
1119 aa  54.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  30.72 
 
 
626 aa  53.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  29.7 
 
 
629 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.32 
 
 
1489 aa  52  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  32.65 
 
 
2578 aa  51.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  23.24 
 
 
1769 aa  51.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.3 
 
 
995 aa  51.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.09 
 
 
3506 aa  50.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  24.02 
 
 
1068 aa  50.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.4 
 
 
1134 aa  49.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.41 
 
 
1673 aa  49.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.54 
 
 
1242 aa  49.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  25.13 
 
 
985 aa  49.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  28.04 
 
 
1672 aa  49.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  23.51 
 
 
3954 aa  48.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.22 
 
 
986 aa  48.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.91 
 
 
1012 aa  48.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.63 
 
 
1741 aa  48.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.36 
 
 
1001 aa  48.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 
1004 aa  47.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 
939 aa  47.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  21.81 
 
 
4238 aa  47  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.99 
 
 
972 aa  47  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  21.81 
 
 
3822 aa  47  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  25.09 
 
 
2083 aa  46.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  28.17 
 
 
1971 aa  46.6  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.96 
 
 
774 aa  46.6  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  26.37 
 
 
636 aa  46.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>