More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1086 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  46.04 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.76 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  46.76 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1049  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  30.99 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.547812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.6 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  30.33 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  43.88 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.33 
 
 		 210 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  43.88 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  43.88 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  50.45 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  48.03 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  43.17 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  46.83 
 
 		 454 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.45 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  52.21 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  50 
 
 		 457 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.97 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.57 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  53.64 
 
 		 443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 468 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  50.44 
 
 		 447 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  52.83 
 
 		 427 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  43.07 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  47.71 
 
 		 428 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  45.24 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  43.65 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  46.73 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1023  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  30.92 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.65 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  40.88 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 434 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.41 
 
 		 394 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  47.66 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  44.25 
 
 		 224 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  37.68 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  33.81 
 
 		 377 aa  99.4  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 202 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 202 aa  99  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 185 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 200 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  44.86 
 
 		 201 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.97 
 
 		 374 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 202 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 202 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  44.44 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  37.5 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  36.3 
 
 		 201 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.45 
 
 		 218 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 229 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  47 
 
 		 236 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.49 
 
 		 236 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 201 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.12 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 248 aa  92.4  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 623 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.99 
 
 		 478 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.96 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 201 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.68 
 
 		 205 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  39.2 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.32 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  39.2 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.89 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.27 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 227 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 537 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 201 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.34 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.72 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 224 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.35 
 
 		 1755 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>