176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1049 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1049  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.547812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1023  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  38.04 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.59 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.02 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.43 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  49.06 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  49.06 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 613 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  48.98 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  31.65 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  48.98 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.8 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  48.98 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.66 
 
 		 172 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  46.94 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3185  OmpA/MotB domain-containing protein  46.94 
 
 		 197 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  46.94 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.59 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 		 401 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  34.15 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.37 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  34.15 
 
 		 350 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  46.94 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  30.77 
 
 		 367 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.37 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.37 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  42.86 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.37 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.55 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40 
 
 		 211 aa  49.7  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 428 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 457 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.56 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.73 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  30.48 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  29.07 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  44.9 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.86 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  29.29 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.86 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.82 
 
 		 478 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.31 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 		 454 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  34.29 
 
 		 626 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  40.79 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02683  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.86 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.78 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  37.21 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0378164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  32.14 
 
 		 466 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.87 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.87 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  38.78 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.78 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.86 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 169 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 486 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  38.78 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 177 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.73 
 
 		 167 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  40.82 
 
 		 180 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 		 679 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  36 
 
 		 157 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  36.73 
 
 		 170 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  31.43 
 
 		 170 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.82 
 
 		 180 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 671 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  40.82 
 
 		 180 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  31.88 
 
 		 170 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.29 
 
 		 163 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 162 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  36.84 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  30 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.82 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>