More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1023 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1023  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1049  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  38.04 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.547812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  36.02 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.65 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  50 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  50 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  49.15 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.06 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  45.76 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  48.21 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.78 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  44.78 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.3 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.65 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  37.63 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.65 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.23 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  45.83 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  39.47 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  45.76 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  41.18 
 
 		 350 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02683  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.27 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  36.84 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  41.18 
 
 		 350 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.18 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  41.27 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  48.21 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.18 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  45.45 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  50.91 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 434 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  46.43 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  45.61 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.27 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  44.26 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  48.21 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  35.8 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.84 
 
 		 172 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 457 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 432 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.76 
 
 		 429 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.86 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.86 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  39.34 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.06 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  42.86 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 		 468 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  39.34 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  52.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 180 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  42.62 
 
 		 333 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 466 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.68 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.71 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.82 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.29 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  46.67 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.37 
 
 		 427 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  43.64 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.29 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.62 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.1 
 
 		 169 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0728  OmpA domain-containing protein  32.98 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0826309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.09 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  38.46 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.25 
 
 		 173 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  40 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  39.68 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.45 
 
 		 180 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 169 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4594  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  42.19 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.29 
 
 		 169 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.03 
 
 		 394 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.82 
 
 		 188 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.68 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  38.03 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 333 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>