221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1987 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  100 
 
 		 430 aa  884    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  45.06 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  45.32 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  44.5 
 
 		 440 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  43.83 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  41.81 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  43.3 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  43.83 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  43.58 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17320  outer membrane porin  43.64 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  42.39 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.61 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.61 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  40.29 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.81 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  41.41 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.97 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  38.73 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  41.67 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  38.97 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  41.41 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  39.51 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  40.75 
 
 		 416 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  37.95 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  41.3 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  42.82 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  42.82 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  42.31 
 
 		 416 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  40.05 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  42.32 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  43.94 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  39.81 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.75 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  42.32 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  42.43 
 
 		 411 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.26 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  41.35 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  42.49 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40.81 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.33 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  40.59 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  38.82 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.86 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  39.47 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  38.61 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  41.65 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  38.77 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  38.77 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  39.57 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  40.9 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  40.65 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  39.48 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  38.12 
 
 		 417 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  37.71 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  37.61 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  37.86 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  40.25 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  37.56 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  39.02 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  36.84 
 
 		 416 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  38.48 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  38.48 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  39.1 
 
 		 428 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  38.89 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  38.89 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  37.75 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  39.01 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  39.15 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  38.74 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  36.8 
 
 		 413 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.59 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  39.01 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  38.48 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  38.05 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  38.4 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  38.68 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.11 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  38.35 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  38.1 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  38.41 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  38.73 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  38.37 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  37.41 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.25 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  37.24 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  37.24 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  36.98 
 
 		 420 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  37.1 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  39.06 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  36 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  35.99 
 
 		 421 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  36.62 
 
 		 408 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  36.98 
 
 		 417 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  37.44 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  38.06 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  38.59 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  37.47 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  37.23 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  36.56 
 
 		 423 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  35.44 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>