219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17320  outer membrane porin  100 
 
 
402 aa  826    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  44.72 
 
 
423 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  44.96 
 
 
423 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  43.77 
 
 
427 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  43.64 
 
 
430 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  43.42 
 
 
424 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40.8 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  39.9 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  39.9 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  40.66 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  39.9 
 
 
429 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  40.15 
 
 
429 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  39.39 
 
 
429 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  41.28 
 
 
422 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  39.9 
 
 
429 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  39.9 
 
 
427 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  39.3 
 
 
440 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  38.81 
 
 
421 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  39.42 
 
 
421 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  38.77 
 
 
421 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  38.52 
 
 
421 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  40.15 
 
 
423 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  39.07 
 
 
416 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  40.35 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  40.35 
 
 
416 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  37.1 
 
 
427 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  39.8 
 
 
416 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.5 
 
 
418 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  40.1 
 
 
416 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.71 
 
 
426 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.75 
 
 
418 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  38.96 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  37.56 
 
 
433 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  36.61 
 
 
433 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  37.22 
 
 
433 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  38.61 
 
 
430 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  38.61 
 
 
416 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  38.37 
 
 
430 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  38.5 
 
 
416 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  36.57 
 
 
433 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  38.67 
 
 
428 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.1 
 
 
431 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  38.64 
 
 
408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.57 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  38.12 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  36.61 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  36.71 
 
 
410 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  38 
 
 
416 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  37.22 
 
 
416 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  35.99 
 
 
410 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.88 
 
 
411 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  35.99 
 
 
417 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  35.99 
 
 
410 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  36.88 
 
 
431 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  37.56 
 
 
409 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  36.03 
 
 
447 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  37.16 
 
 
418 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  37.13 
 
 
424 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  36.88 
 
 
422 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  37.13 
 
 
409 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  37.41 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.05 
 
 
417 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  36.03 
 
 
442 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  37.22 
 
 
408 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  36.19 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  35.94 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  36.01 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  36.82 
 
 
417 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  34.73 
 
 
439 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  35.28 
 
 
439 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  34.9 
 
 
423 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  34.49 
 
 
417 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.32 
 
 
417 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  34.77 
 
 
463 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.09 
 
 
418 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  34.09 
 
 
418 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  34.74 
 
 
443 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  34.66 
 
 
413 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  34.96 
 
 
417 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  33.83 
 
 
418 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  35.43 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  36.74 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  34.43 
 
 
440 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  35.43 
 
 
412 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  33.8 
 
 
441 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  34.17 
 
 
416 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  34.18 
 
 
424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  34.67 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  33.17 
 
 
420 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  34.92 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  33.73 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  35.4 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  35.16 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  35.16 
 
 
417 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  34.35 
 
 
415 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  33.5 
 
 
395 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  35.24 
 
 
426 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  33.09 
 
 
405 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  34 
 
 
422 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  33.73 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>