222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  94.8 
 
 		 427 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  99.29 
 
 		 423 aa  855    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  100 
 
 		 423 aa  859    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  50.98 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  51.25 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  48.41 
 
 		 440 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  46.42 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  46.17 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  45.68 
 
 		 429 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  45.68 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17320  outer membrane porin  44.96 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  41.61 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  44.25 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  44.5 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  43.26 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  43.02 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  44.36 
 
 		 421 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  41.39 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  42.09 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  43.23 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  41.82 
 
 		 427 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  40.85 
 
 		 422 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43.75 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  40.28 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  40.52 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40.65 
 
 		 418 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.28 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  40.75 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  39.22 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  40.19 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.92 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  38.92 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  39.91 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.83 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  40.99 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  40.74 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.33 
 
 		 412 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  38.93 
 
 		 420 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  40.49 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  39.53 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.58 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  40.25 
 
 		 410 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  38.97 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  39.95 
 
 		 417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  38.73 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  38.37 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  40.14 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  41.05 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  41.58 
 
 		 409 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  39.54 
 
 		 416 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  39.31 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  39.76 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  40.38 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  37 
 
 		 447 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  39.01 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  40.65 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  39.75 
 
 		 415 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  38.9 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  39.65 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  38.62 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  38.55 
 
 		 417 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  37.47 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  38.31 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  36.81 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  40.15 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  37.91 
 
 		 416 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  35.66 
 
 		 439 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  38.37 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  34.83 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  36.4 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  37.35 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  38.43 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  37.9 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  36.19 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  38.22 
 
 		 417 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  35.78 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  36.95 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  37.75 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  38.29 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  36.34 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.62 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  37.97 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  38.82 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  38.82 
 
 		 430 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.6 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  38.57 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36.36 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  37.17 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  37.84 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  37.44 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  36.47 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.21 
 
 		 418 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  36.23 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  36.71 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  36.76 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  35.7 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  35.85 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  35.58 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  36.06 
 
 		 412 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  36.66 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>