224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  100 
 
 		 439 aa  888    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  88.3 
 
 		 441 aa  780    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  85.29 
 
 		 443 aa  759    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  86.81 
 
 		 439 aa  769    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  86.7 
 
 		 440 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  78.91 
 
 		 457 aa  711    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  64.32 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  61.37 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  61.76 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  60.14 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  58.95 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  55.97 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  54.73 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  52.38 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  51.24 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  52.35 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  44.62 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  43.33 
 
 		 421 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  47.8 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  43.11 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  47.06 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  47.25 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  46.97 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  44.71 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  45.27 
 
 		 448 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  43.21 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  42.14 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41.74 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  40.95 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  41.39 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  41.87 
 
 		 418 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.74 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  38.5 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  42.25 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  38.5 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  38.41 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.91 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.45 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  38.27 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  39.68 
 
 		 421 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  41.69 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  39.36 
 
 		 416 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  43.26 
 
 		 418 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  41.99 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  40.09 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.61 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  38.96 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  38.6 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  35.92 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  38.58 
 
 		 431 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.42 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  38.23 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  39.73 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  40.14 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  39.05 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  36.68 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  39.5 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.92 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  35.7 
 
 		 429 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.81 
 
 		 416 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  38.16 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  38.88 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.93 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  38.16 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  36.1 
 
 		 417 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  38.57 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.1 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  37.5 
 
 		 418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  34.81 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  39.22 
 
 		 416 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.28 
 
 		 410 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  37.47 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  37.92 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.1 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  37.02 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  37.7 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  37.22 
 
 		 423 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  36.71 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.49 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  37.02 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.19 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  36.55 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  37.86 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  37.19 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  35.97 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.08 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.7 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  36.02 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  35.32 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  37.59 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  35.66 
 
 		 423 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  37.05 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  35.66 
 
 		 423 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  37.12 
 
 		 395 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  37.21 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  34.62 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  35.51 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  36 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  34.58 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>