232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5417 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  100 
 
 		 447 aa  899    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  62.72 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  63.25 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  58.06 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  52.97 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  56.64 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  51.88 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  52.95 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  52.04 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  54.17 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  53.29 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  50.55 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  50.22 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  51.1 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  52.2 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  52.33 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  50.94 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  49.03 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  47.73 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  46.3 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  45.83 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  47.64 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  45.99 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  46.2 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  45.43 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  45.39 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  44.96 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  44.1 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  42.18 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  45.08 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  45.08 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  41.86 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  43.15 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  43.15 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  42.86 
 
 		 429 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.15 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  42.62 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  42.35 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.85 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  40.49 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  41.86 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.94 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  39.78 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  40.53 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  40.52 
 
 		 408 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  41.56 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.93 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  40.66 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  39.64 
 
 		 416 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  38.03 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  41.42 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  37.42 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  37.81 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.46 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.03 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  39.69 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  38.98 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  40 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  40.05 
 
 		 409 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.53 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  38.67 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.67 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  38.67 
 
 		 410 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  37.67 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  36.83 
 
 		 427 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  37.53 
 
 		 420 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.14 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  37.39 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  37.05 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  39.14 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.79 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  37.19 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  37.11 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  38.96 
 
 		 418 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.42 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  38.69 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  39.19 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.1 
 
 		 430 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  39.39 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  37.39 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.08 
 
 		 412 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.22 
 
 		 412 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  36.94 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  37.16 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  37.61 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  38.95 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  37.61 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  36.75 
 
 		 412 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.05 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.56 
 
 		 412 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  38.63 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  37.61 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  38.41 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  37.69 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.98 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  37.78 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  36.85 
 
 		 417 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  36.98 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  34.74 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  36.24 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>