226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21290 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  80.95 
 
 		 439 aa  703    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  80.14 
 
 		 439 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  100 
 
 		 457 aa  929    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  82.22 
 
 		 440 aa  739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  81.43 
 
 		 441 aa  705    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  79.45 
 
 		 443 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  61.1 
 
 		 442 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  59.56 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  60.24 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  59.76 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  59.59 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  55.53 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  55.6 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  54.61 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  53.14 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  52.95 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  48.45 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  48.12 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  48.1 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  46.93 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  44.11 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  45.18 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  44.75 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  42.79 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  42.34 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.63 
 
 		 422 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  41.55 
 
 		 427 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  41.88 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41.33 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.76 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.33 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  42.38 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  41.4 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  41.74 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  39.95 
 
 		 421 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  40.09 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  38.77 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  40.23 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  41.15 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  41.61 
 
 		 416 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  38.3 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  38.06 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  38.06 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  42.55 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  40.88 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.84 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  38.83 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  38.2 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  36.95 
 
 		 423 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  39.64 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  39.64 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  38.67 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  38.52 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  36.81 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  37.64 
 
 		 418 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.23 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  39.48 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  36.66 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  37.44 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  36.66 
 
 		 429 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  37.17 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  37.33 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  37.77 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  37.56 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  36.05 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  38.99 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  38.41 
 
 		 424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  37.76 
 
 		 412 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.73 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.64 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.64 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.15 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.06 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  38.24 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  36.81 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36.28 
 
 		 418 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  36.77 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.51 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.37 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  35.88 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  38.06 
 
 		 395 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  38.3 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  36.66 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  38.36 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  37.76 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  39.07 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.13 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  38.84 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  37.53 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.7 
 
 		 416 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  37.59 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  37.53 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  37.27 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  37.61 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.84 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  36.64 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  38.37 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  37.04 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  37.61 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>