232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01240 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  87.95 
 
 
441 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  86.08 
 
 
439 aa  767    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  89.88 
 
 
439 aa  781    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  82.73 
 
 
443 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  100 
 
 
440 aa  900    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  82.22 
 
 
457 aa  739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  63.12 
 
 
442 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  59.3 
 
 
456 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  60.48 
 
 
442 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  58.11 
 
 
460 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  60.8 
 
 
445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  57.52 
 
 
463 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  58.57 
 
 
439 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  52.97 
 
 
447 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  52.12 
 
 
437 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  50.44 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  48.15 
 
 
444 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  44.62 
 
 
443 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  48.36 
 
 
443 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  46.05 
 
 
448 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  48.13 
 
 
442 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  47.95 
 
 
446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  44.71 
 
 
422 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  45.48 
 
 
448 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  42.86 
 
 
427 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  42.14 
 
 
427 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  42.54 
 
 
421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  42.54 
 
 
421 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  42.42 
 
 
417 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40.8 
 
 
418 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  41.82 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  42.19 
 
 
417 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  39.52 
 
 
429 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  40 
 
 
429 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  39.76 
 
 
429 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  39.76 
 
 
429 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  40.75 
 
 
450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  41.45 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  38.89 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  38.18 
 
 
421 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  39.12 
 
 
433 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  40.14 
 
 
416 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.66 
 
 
429 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  38.62 
 
 
433 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  38.77 
 
 
421 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  40.45 
 
 
437 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  40.5 
 
 
408 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  37.39 
 
 
433 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.98 
 
 
418 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  37.95 
 
 
412 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  39.3 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  37.97 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  39.72 
 
 
431 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  39.12 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  37.67 
 
 
416 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  38.53 
 
 
416 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.29 
 
 
412 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.57 
 
 
418 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.29 
 
 
412 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  36.96 
 
 
418 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  37.84 
 
 
412 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.39 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  38.17 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  35.94 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  36.32 
 
 
415 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  37.09 
 
 
422 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  38.72 
 
 
416 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  38.17 
 
 
417 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.65 
 
 
420 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  37.53 
 
 
418 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.65 
 
 
420 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  37.7 
 
 
424 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  36.91 
 
 
423 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.53 
 
 
419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  36.94 
 
 
422 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  38.72 
 
 
415 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  36.85 
 
 
416 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.08 
 
 
418 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  36.85 
 
 
416 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  35.71 
 
 
417 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.72 
 
 
416 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  36.85 
 
 
416 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  36.47 
 
 
417 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  37.81 
 
 
416 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  35.86 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  35.49 
 
 
422 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.1 
 
 
409 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.79 
 
 
418 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  38.1 
 
 
409 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  36.24 
 
 
410 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  36.24 
 
 
410 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  35.43 
 
 
413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  37.24 
 
 
430 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  37.59 
 
 
395 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  35.93 
 
 
426 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  36.24 
 
 
410 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  36.17 
 
 
428 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  34.81 
 
 
427 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  34.64 
 
 
423 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  34.64 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>