225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  100 
 
 
445 aa  899    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  65.65 
 
 
442 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  61.25 
 
 
440 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  59.74 
 
 
460 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  59.78 
 
 
463 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  60.13 
 
 
443 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  61.68 
 
 
439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  62.33 
 
 
439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  59.55 
 
 
457 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  61.32 
 
 
439 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  60.85 
 
 
441 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  57.59 
 
 
443 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  58.06 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  54.81 
 
 
442 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  53.72 
 
 
443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  50.76 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  52.98 
 
 
437 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  50.32 
 
 
444 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  50.11 
 
 
442 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  49.67 
 
 
443 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000630026  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  46.88 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  49.68 
 
 
446 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  45.93 
 
 
448 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  43.36 
 
 
422 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  43.32 
 
 
427 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  43.33 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  44.84 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  43.95 
 
 
418 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  44.39 
 
 
417 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.54 
 
 
429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  44.17 
 
 
417 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  42.36 
 
 
421 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.67 
 
 
421 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  42.13 
 
 
421 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.96 
 
 
429 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  43.19 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43.19 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  42.79 
 
 
450 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  43.24 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  42.95 
 
 
408 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  42.06 
 
 
421 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  41.43 
 
 
408 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  39.01 
 
 
433 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  40.85 
 
 
437 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  39.33 
 
 
433 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  40.94 
 
 
416 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  39.55 
 
 
429 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  39.33 
 
 
433 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  40.78 
 
 
417 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.92 
 
 
418 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.69 
 
 
418 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  38.65 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  39.55 
 
 
411 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  40.49 
 
 
416 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  39.55 
 
 
412 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  39.46 
 
 
431 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  38.79 
 
 
431 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  39.73 
 
 
410 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  39.51 
 
 
410 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  39.29 
 
 
417 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  39.29 
 
 
423 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  38.88 
 
 
418 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  40.71 
 
 
416 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  39.73 
 
 
410 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  37.92 
 
 
418 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  40.27 
 
 
416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  40.04 
 
 
416 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  40.04 
 
 
416 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  38.14 
 
 
415 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  39.38 
 
 
416 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  37.44 
 
 
422 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  38.06 
 
 
418 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  38.14 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  37.84 
 
 
418 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.7 
 
 
416 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  38.5 
 
 
423 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  37.56 
 
 
418 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.01 
 
 
412 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  38.48 
 
 
427 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  37.78 
 
 
416 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  37.78 
 
 
412 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  36.71 
 
 
417 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.38 
 
 
420 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  39.2 
 
 
421 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  40.65 
 
 
409 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.16 
 
 
420 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.37 
 
 
430 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  35.45 
 
 
427 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  38.27 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  37.88 
 
 
422 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.56 
 
 
412 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  40.42 
 
 
409 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  36.91 
 
 
417 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  38.61 
 
 
415 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  37.04 
 
 
424 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  37.06 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  35.76 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  37.21 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.02 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  36.28 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>