More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3382 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  65.98 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  62.7 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  61.07 
 
 		 256 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  60.25 
 
 		 244 aa  295  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  58.2 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  57.96 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  57.14 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  45.9 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  46.53 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  47.56 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  46.31 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  48.36 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 		 259 aa  214  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  46.94 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  44.67 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  46.53 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  46.5 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  45.12 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  43.32 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  40.38 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  40.57 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  43.03 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  43.03 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  41.56 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  43.9 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  40.49 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  40.66 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  40.66 
 
 		 351 aa  184  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  43.62 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  43.27 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  41.98 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  42.57 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  40.66 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  40.48 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1259  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  35.1 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  37.24 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1896  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2081  pseudouridylate synthase  41.11 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.999551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3817  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1662  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  40.42 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 261 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  41.98 
 
 		 285 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  40.42 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  39.36 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0411  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  41.13 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>