More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1116 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 472 aa  927    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  45.89 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 477 aa  349  5e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  46.12 
 
 		 465 aa  348  9e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  39.38 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.38 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 		 533 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.43 
 
 		 594 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.43 
 
 		 594 aa  256  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  36.83 
 
 		 534 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  35.34 
 
 		 533 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.05 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.73 
 
 		 525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 554 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 554 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.92 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  36.81 
 
 		 740 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.09 
 
 		 856 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.29 
 
 		 856 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 		 735 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  35.94 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 533 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.32 
 
 		 531 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.84 
 
 		 759 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.86 
 
 		 533 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.9 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.6 
 
 		 554 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  36.65 
 
 		 530 aa  242  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.87 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.95 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.36 
 
 		 853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  36.03 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  37.31 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 531 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.15 
 
 		 556 aa  239  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 		 532 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.91 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  34.53 
 
 		 534 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  33.42 
 
 		 534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  35.49 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  36.64 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  36.14 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  36.14 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  34.42 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  36.41 
 
 		 531 aa  232  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  33.5 
 
 		 534 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  33.93 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 843 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  36.22 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.06 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.98 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.2 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  36.54 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  36.17 
 
 		 471 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.64 
 
 		 849 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  38.07 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  35.99 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.62 
 
 		 848 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  33.08 
 
 		 535 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  35.78 
 
 		 748 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  33.7 
 
 		 613 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.68 
 
 		 759 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  33.49 
 
 		 416 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  32.91 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  32.96 
 
 		 613 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  33.42 
 
 		 532 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.55 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  33.42 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.46 
 
 		 535 aa  223  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  34.3 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  34.19 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  34.22 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 537 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  33.03 
 
 		 410 aa  220  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.99 
 
 		 756 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  33.65 
 
 		 473 aa  219  7.999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  34.37 
 
 		 604 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  34.88 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  35.06 
 
 		 625 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 534 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  35.57 
 
 		 512 aa  216  9e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  33.25 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  41.51 
 
 		 595 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>