More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0380 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0380  VCBS  100 
 
 
1586 aa  3087    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  39.08 
 
 
7284 aa  147  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  56.76 
 
 
7149 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  43.24 
 
 
16311 aa  123  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  61.22 
 
 
6678 aa  107  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.26 
 
 
3191 aa  95.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  34.17 
 
 
2555 aa  92.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  37.1 
 
 
5769 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.81 
 
 
2678 aa  84  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.77 
 
 
4798 aa  84  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  45.79 
 
 
3714 aa  82  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.37 
 
 
1499 aa  81.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.59 
 
 
1279 aa  80.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.16 
 
 
860 aa  81.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.25 
 
 
980 aa  80.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.5 
 
 
3598 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 
3508 aa  80.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.33 
 
 
855 aa  78.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.56 
 
 
1156 aa  78.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.68 
 
 
3619 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.89 
 
 
3816 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.68 
 
 
3619 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.14 
 
 
4687 aa  75.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.51 
 
 
4854 aa  75.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  39.61 
 
 
1728 aa  74.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.14 
 
 
2346 aa  74.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  35.48 
 
 
8682 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.83 
 
 
959 aa  73.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  37.1 
 
 
9030 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.94 
 
 
1884 aa  73.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.37 
 
 
1306 aa  72.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  30.94 
 
 
4723 aa  72.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.57 
 
 
2816 aa  72.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  31.38 
 
 
595 aa  72.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.67 
 
 
1607 aa  72  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.18 
 
 
1363 aa  72  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  40.58 
 
 
2337 aa  71.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
219 aa  70.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.86 
 
 
1814 aa  70.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  47.12 
 
 
2667 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.05 
 
 
4334 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27 
 
 
2245 aa  70.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  40.23 
 
 
5094 aa  70.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.73 
 
 
2954 aa  70.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.93 
 
 
5962 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  29.22 
 
 
1112 aa  70.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  40 
 
 
4978 aa  69.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  35.48 
 
 
6753 aa  68.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.87 
 
 
1217 aa  68.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.18 
 
 
3209 aa  68.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.03 
 
 
1480 aa  67.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 
3229 aa  67.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.32 
 
 
556 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3540  putative adhesin or RTX toxin  36 
 
 
2060 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  31.03 
 
 
833 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  29.28 
 
 
5218 aa  67  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 
2329 aa  67  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
767 aa  67  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.12 
 
 
2107 aa  67  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  40.91 
 
 
1883 aa  66.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  41.3 
 
 
232 aa  66.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.57 
 
 
2689 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.5 
 
 
3954 aa  65.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.84 
 
 
4848 aa  65.9  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.11 
 
 
1855 aa  65.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  28.98 
 
 
460 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.75 
 
 
518 aa  64.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 
946 aa  65.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 
868 aa  64.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 
526 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.41 
 
 
686 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.82 
 
 
3026 aa  64.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  34.64 
 
 
3544 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  30.33 
 
 
2001 aa  64.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.11 
 
 
2704 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  25.91 
 
 
515 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.53 
 
 
5098 aa  63.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 
1215 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  41.77 
 
 
507 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.26 
 
 
1789 aa  63.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.72 
 
 
1180 aa  63.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 
761 aa  63.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.58 
 
 
917 aa  63.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 
1215 aa  63.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 
850 aa  63.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.99 
 
 
1236 aa  62.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.36 
 
 
4836 aa  62.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.36 
 
 
1534 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40 
 
 
1424 aa  62.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  49.12 
 
 
4678 aa  62.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 
1287 aa  62.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 
795 aa  62.4  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.41 
 
 
3314 aa  62  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.62 
 
 
4106 aa  62  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  32 
 
 
2542 aa  61.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.98 
 
 
2885 aa  61.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  28.35 
 
 
491 aa  62  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 
361 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 
361 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 
572 aa  61.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>