More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2126 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  88.93 
 
 		 524 aa  896    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  79.57 
 
 		 530 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  63.2 
 
 		 519 aa  692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  66.92 
 
 		 539 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  69.51 
 
 		 528 aa  738    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  76.22 
 
 		 561 aa  823    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  63.84 
 
 		 549 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  76.58 
 
 		 554 aa  830    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  100 
 
 		 533 aa  1056    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  53 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  57.5 
 
 		 519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  58.33 
 
 		 514 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  52.82 
 
 		 522 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  53.02 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.62 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  52.22 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  52.42 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.42 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  52.22 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  52.42 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.62 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.22 
 
 		 522 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  83.13 
 
 		 341 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  52.41 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  47.74 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  52.21 
 
 		 516 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  49.08 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  49.08 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  47.85 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  36.15 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  38.45 
 
 		 516 aa  329  7e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.28 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  31.02 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.87 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32.17 
 
 		 506 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  33.08 
 
 		 558 aa  247  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  33.4 
 
 		 606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  32.53 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.87 
 
 		 550 aa  243  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 503 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  32.05 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  32.44 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.57 
 
 		 538 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.98 
 
 		 508 aa  240  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  31.47 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  31.47 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.62 
 
 		 657 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.68 
 
 		 659 aa  236  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  33.68 
 
 		 659 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  32.53 
 
 		 667 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  31.62 
 
 		 545 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  33.78 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32.44 
 
 		 661 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  32.51 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  32.22 
 
 		 573 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  31.74 
 
 		 531 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.64 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.91 
 
 		 661 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2603  choline transport protein BetT  32.87 
 
 		 685 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  30.08 
 
 		 556 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  30.54 
 
 		 497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 637 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.27 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  32.21 
 
 		 686 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 526 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  32.76 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  32.32 
 
 		 684 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  32.51 
 
 		 606 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  31.88 
 
 		 538 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  29.83 
 
 		 529 aa  223  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  30.41 
 
 		 523 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  31.2 
 
 		 698 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  32.33 
 
 		 534 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  30.4 
 
 		 679 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  30.43 
 
 		 525 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.17 
 
 		 637 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  30 
 
 		 580 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  32.66 
 
 		 611 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  30.91 
 
 		 646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  31.53 
 
 		 603 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  29.68 
 
 		 553 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  32.38 
 
 		 611 aa  217  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.08 
 
 		 656 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  27.72 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.01 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  32.02 
 
 		 660 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  32.75 
 
 		 676 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  32.46 
 
 		 619 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  29.59 
 
 		 677 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  32.5 
 
 		 567 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  29.65 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  33.5 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  32.77 
 
 		 691 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  31 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  29.59 
 
 		 677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  29.59 
 
 		 677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  34.08 
 
 		 582 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>