More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6047 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  60.71 
 
 		 784 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  59.69 
 
 		 827 aa  972    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  87.85 
 
 		 787 aa  1453    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  88.86 
 
 		 790 aa  1463    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  59.11 
 
 		 809 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  59.49 
 
 		 783 aa  955    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  58.54 
 
 		 811 aa  1004    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  61.58 
 
 		 776 aa  1034    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  68.09 
 
 		 796 aa  1147    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  59.06 
 
 		 824 aa  966    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  66.88 
 
 		 793 aa  1117    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  73.35 
 
 		 780 aa  1194    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  58.25 
 
 		 815 aa  970    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  50.19 
 
 		 761 aa  788    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  58.03 
 
 		 815 aa  971    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  58.47 
 
 		 829 aa  1012    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  60.81 
 
 		 825 aa  1032    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  100 
 
 		 788 aa  1632    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  56.14 
 
 		 813 aa  936    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  61.35 
 
 		 800 aa  1020    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  60.22 
 
 		 821 aa  1023    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  57.78 
 
 		 770 aa  920    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  61.41 
 
 		 810 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  56.65 
 
 		 765 aa  947    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  60.32 
 
 		 824 aa  1026    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  79.57 
 
 		 793 aa  1311    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  66.88 
 
 		 791 aa  1120    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  60.79 
 
 		 780 aa  999    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  60.58 
 
 		 817 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  46.11 
 
 		 769 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  60.71 
 
 		 784 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  42.57 
 
 		 790 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  43.79 
 
 		 791 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  42.21 
 
 		 796 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  36.63 
 
 		 771 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  35.09 
 
 		 760 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  34.84 
 
 		 760 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  35.08 
 
 		 776 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  35.54 
 
 		 804 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  32.7 
 
 		 802 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  33.62 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 899 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  33.37 
 
 		 783 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  32.96 
 
 		 797 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  34.41 
 
 		 811 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  31.65 
 
 		 860 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  34.68 
 
 		 899 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  35.54 
 
 		 875 aa  331  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2892  type III restriction protein res subunit  35.19 
 
 		 583 aa  318  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  30.44 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1025  type III restriction enzyme, res subunit  28.6 
 
 		 753 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.83 
 
 		 1188 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  30.19 
 
 		 1115 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.25 
 
 		 1174 aa  174  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  30.23 
 
 		 1130 aa  173  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  29.22 
 
 		 1129 aa  172  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.83 
 
 		 1169 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  27.73 
 
 		 1170 aa  167  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  28.67 
 
 		 1108 aa  167  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  28.11 
 
 		 1125 aa  163  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 932 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  29.11 
 
 		 1113 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 		 932 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  29.51 
 
 		 889 aa  162  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 		 893 aa  161  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  27.58 
 
 		 1119 aa  160  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.57 
 
 		 1167 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.97 
 
 		 1169 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  27.89 
 
 		 1005 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.46 
 
 		 1082 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  27.22 
 
 		 912 aa  159  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  27.81 
 
 		 1137 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3175  type III restriction protein res subunit  28.72 
 
 		 1115 aa  157  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 945 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.94 
 
 		 1080 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.28 
 
 		 1137 aa  156  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  26.86 
 
 		 936 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  26.28 
 
 		 936 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.36 
 
 		 1068 aa  151  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.45 
 
 		 1068 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  28.08 
 
 		 907 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  28.22 
 
 		 1138 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 		 931 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  27.67 
 
 		 1124 aa  147  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.43 
 
 		 1157 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  28.15 
 
 		 1137 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 1138 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  27.65 
 
 		 845 aa  144  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  27.92 
 
 		 934 aa  143  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  28.25 
 
 		 1141 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.29 
 
 		 1126 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 925 aa  140  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1131 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  27.43 
 
 		 917 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 1233 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  26.42 
 
 		 921 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2088  EcoEI R domain protein  34.66 
 
 		 546 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  25.66 
 
 		 1137 aa  134  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  26.81 
 
 		 1133 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>