More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2952 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  100 
 
 		 710 aa  1461    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  50.84 
 
 		 726 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  72.7 
 
 		 681 aa  1013    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  52.47 
 
 		 742 aa  740    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  57.65 
 
 		 694 aa  779    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  97.18 
 
 		 706 aa  1409    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  44.17 
 
 		 709 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 720 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 715 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  41.39 
 
 		 728 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  41.18 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  40.9 
 
 		 706 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  41.04 
 
 		 706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  40.9 
 
 		 706 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  41.04 
 
 		 706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 700 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 700 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 706 aa  459  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 700 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  39.8 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  39.59 
 
 		 736 aa  455  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  39.8 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  40.23 
 
 		 705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 731 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.06 
 
 		 712 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  39.06 
 
 		 743 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 697 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 723 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  39.6 
 
 		 723 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 675 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 688 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 678 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 705 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  30.73 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 680 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 742 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 726 aa  147  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 734 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 736 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.81 
 
 		 727 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 703 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 780 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 737 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 682 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 777 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 688 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 739 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 681 aa  107  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.28 
 
 		 762 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 702 aa  99  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 696 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.92 
 
 		 653 aa  98.2  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 701 aa  97.8  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  24.44 
 
 		 683 aa  97.8  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 705 aa  97.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 791 aa  97.4  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 810 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  23.91 
 
 		 690 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 769 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 801 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 690 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 713 aa  93.2  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 700 aa  92.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 683 aa  92  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.19 
 
 		 806 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 836 aa  92.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2074  TonB domain-containing protein  25.74 
 
 		 741 aa  91.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 653 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 711 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 678 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 793 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.83 
 
 		 692 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 810 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 742 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 688 aa  88.2  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 741 aa  88.6  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  22.96 
 
 		 717 aa  87.8  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.5 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 681 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  22.42 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.32 
 
 		 833 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 700 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.11 
 
 		 797 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2605  OM receptor TonB  24.39 
 
 		 787 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0978096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  22.99 
 
 		 703 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>