More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54590 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  48.7 
 
 
903 aa  843    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  45.13 
 
 
893 aa  777    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  100 
 
 
901 aa  1843    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.4 
 
 
303 aa  332  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.08 
 
 
303 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  52.72 
 
 
306 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
304 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  53.06 
 
 
303 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  53.06 
 
 
303 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 
306 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.66 
 
 
303 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.48 
 
 
913 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
710 aa  282  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
305 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.99 
 
 
299 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  48.56 
 
 
286 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
301 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
287 aa  264  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
288 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
287 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
300 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
287 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
287 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
305 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 
300 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
326 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
305 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
305 aa  251  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
298 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  45.91 
 
 
305 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 
302 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
303 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 
303 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
307 aa  233  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
304 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
310 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.51 
 
 
302 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
306 aa  230  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
302 aa  221  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
313 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 
315 aa  214  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  43.84 
 
 
305 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
296 aa  210  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.68 
 
 
305 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
313 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
300 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
306 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
306 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
306 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
324 aa  204  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  45.12 
 
 
304 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
301 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
301 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
301 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
301 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
324 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
324 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
324 aa  201  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
301 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 
301 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.78 
 
 
292 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 
301 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
303 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
309 aa  193  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
303 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
305 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
301 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 
304 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
304 aa  191  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
306 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  43.14 
 
 
304 aa  189  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
304 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
301 aa  187  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
301 aa  187  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
311 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  43.95 
 
 
292 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
330 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
298 aa  185  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
305 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  43.19 
 
 
350 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
310 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
301 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
294 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
301 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
304 aa  178  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
304 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
301 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
307 aa  175  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 
291 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.92 
 
 
304 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
300 aa  171  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
334 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
301 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
301 aa  168  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
306 aa  167  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
245 aa  167  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
317 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
351 aa  166  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
305 aa  164  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>