More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8749 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
317 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  44.48 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 
303 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
303 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
304 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
309 aa  209  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
301 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
334 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.43 
 
 
305 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
305 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
301 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  42.7 
 
 
305 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
301 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.02 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  44.05 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
305 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
305 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
304 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
305 aa  192  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  42.81 
 
 
291 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  46.51 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 
301 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
301 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 
301 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
287 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  46.03 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
301 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
301 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
287 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  45.21 
 
 
304 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
287 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
306 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
299 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
288 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.41 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
913 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
301 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
303 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
320 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
710 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
303 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  41.94 
 
 
303 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  41.94 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
309 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
319 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
300 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  38.57 
 
 
901 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
306 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
310 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
313 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
303 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
292 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
310 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
303 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
311 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
296 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  39.78 
 
 
292 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.16 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
305 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.18 
 
 
301 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  41.98 
 
 
893 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
300 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
292 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
307 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
309 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
307 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.44 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.91 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  41.28 
 
 
292 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 
247 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
332 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
315 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
306 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
247 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
313 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
251 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  41.8 
 
 
903 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
246 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
351 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00537016  hitchhiker  0.0000965646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>