More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0293 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
307 aa  594  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00537016  hitchhiker  0.0000965646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62 
 
 
303 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4900  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.86 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 
300 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 
301 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 
301 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 
301 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
301 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  43.49 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
309 aa  182  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
304 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
298 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
301 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
307 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
303 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
306 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.4 
 
 
245 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  42.59 
 
 
292 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
317 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
304 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  38.14 
 
 
304 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.23 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
246 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.33 
 
 
305 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
301 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
301 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  36.49 
 
 
305 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.87 
 
 
247 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
304 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
245 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
301 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 
309 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.53 
 
 
247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
305 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
244 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.97 
 
 
245 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
299 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.1 
 
 
250 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
301 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.05 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  35.26 
 
 
893 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.9 
 
 
246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.44 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
246 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 
255 aa  162  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
304 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  42.8 
 
 
252 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
246 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.47 
 
 
307 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
301 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.47 
 
 
307 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
293 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
249 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.95 
 
 
306 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  40.48 
 
 
250 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  40.08 
 
 
247 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
311 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
305 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
253 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 
246 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
334 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
276 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.011223  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
305 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.71 
 
 
250 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 
246 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 
247 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
246 aa  159  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
254 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
303 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
246 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.7 
 
 
310 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
913 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
313 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
245 aa  155  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.33 
 
 
306 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
249 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
246 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
301 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
247 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
304 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>