More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5894 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.61 
 
 
308 aa  315  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.95 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.03 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.59 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.68 
 
 
296 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.23 
 
 
317 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.33 
 
 
306 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.17 
 
 
307 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.17 
 
 
307 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
296 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50 
 
 
307 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50 
 
 
310 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
301 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.48 
 
 
301 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  47.22 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 
301 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 
301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 
301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 
301 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  49.62 
 
 
293 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 
301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
301 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.47 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
311 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
310 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  49.27 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
301 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
309 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
295 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
299 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
307 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
351 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
298 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
317 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
303 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
316 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
303 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
306 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
288 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
246 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
287 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
287 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
913 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.48 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5825  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.13 
 
 
250 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
287 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
320 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
287 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.02 
 
 
250 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.19 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  39.37 
 
 
901 aa  162  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  36.47 
 
 
893 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.53 
 
 
247 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
292 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.63 
 
 
246 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  40.55 
 
 
252 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  39.71 
 
 
304 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
248 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
301 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  43.03 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
332 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4754  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
276 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  41.25 
 
 
286 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
246 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  42.17 
 
 
903 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
276 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.46 
 
 
246 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
270 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
246 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
246 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
710 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
276 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.011223  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
300 aa  155  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
303 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
245 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
304 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
304 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
254 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.23 
 
 
306 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
250 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
250 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.18 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
303 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
245 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  39.02 
 
 
350 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  38.72 
 
 
305 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>