More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50482 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50482  predicted protein  100 
 
 		 1188 aa  2462    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  32.01 
 
 		 313 aa  160  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  39.52 
 
 		 309 aa  157  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  34.74 
 
 		 309 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  40.16 
 
 		 323 aa  155  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.84 
 
 		 311 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  38.91 
 
 		 311 aa  154  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  36.49 
 
 		 308 aa  154  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  37.55 
 
 		 311 aa  154  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  36.3 
 
 		 309 aa  152  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  33.43 
 
 		 307 aa  152  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  38.65 
 
 		 307 aa  152  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  37.02 
 
 		 309 aa  151  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  37.6 
 
 		 309 aa  151  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  38.8 
 
 		 348 aa  150  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.2 
 
 		 309 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  38.96 
 
 		 308 aa  149  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 		 309 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  34.15 
 
 		 337 aa  147  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  34.45 
 
 		 326 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  36.65 
 
 		 316 aa  145  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  37.05 
 
 		 309 aa  144  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  34.81 
 
 		 347 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  37.01 
 
 		 315 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  37.94 
 
 		 314 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2302  histone deacetylase superfamily  36.43 
 
 		 319 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  33.22 
 
 		 316 aa  142  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1476  histone deacetylase superfamily protein  31.54 
 
 		 307 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.436214  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  35.84 
 
 		 324 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2813  histone deacetylase superfamily protein  36.08 
 
 		 319 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  37.3 
 
 		 309 aa  140  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  36.65 
 
 		 309 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  35.29 
 
 		 307 aa  140  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  37.5 
 
 		 309 aa  140  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  37.5 
 
 		 309 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  34.51 
 
 		 344 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  33.01 
 
 		 321 aa  139  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  37.65 
 
 		 310 aa  138  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  36.8 
 
 		 317 aa  137  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 307 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  38.25 
 
 		 309 aa  137  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  34 
 
 		 328 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  34.4 
 
 		 309 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1558  histone deacetylase superfamily protein  34.4 
 
 		 314 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.643913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  34 
 
 		 325 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  35.6 
 
 		 306 aa  135  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.05 
 
 		 308 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_4423  predicted protein  35.32 
 
 		 284 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0855  histone deacetylase superfamily protein  31.31 
 
 		 306 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00186  Histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 		 308 aa  132  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  37.78 
 
 		 307 aa  131  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  33.91 
 
 		 307 aa  131  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  36.55 
 
 		 309 aa  131  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1655  histone deacetylase family protein  37.4 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0416  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0936  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0213  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2934  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.664786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2872  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3319  histone deacetylase superfamily protein  40.36 
 
 		 306 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2560  histone deacetylase family protein  32.67 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2095  histone deacetylase superfamily protein  33.56 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2982  histone deacetylase family protein  32.34 
 
 		 307 aa  128  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  29.18 
 
 		 352 aa  128  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  32.03 
 
 		 364 aa  128  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1648  histone deacetylase family protein  32.45 
 
 		 307 aa  128  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.406778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  32.81 
 
 		 312 aa  126  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  33.06 
 
 		 341 aa  127  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2164  histone deacetylase superfamily protein  33.1 
 
 		 318 aa  126  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  36.25 
 
 		 319 aa  127  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  32.13 
 
 		 341 aa  126  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0057  histone deacetylase superfamily protein  33.2 
 
 		 308 aa  125  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620754  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  35.34 
 
 		 309 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  35.6 
 
 		 307 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2503  histone deacetylase superfamily protein  32.03 
 
 		 308 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  32.82 
 
 		 306 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3145  histone deacetylase superfamily protein  35.6 
 
 		 317 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1246  putative histone deacetylase-family protein  33.55 
 
 		 313 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0489566  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1360  Histone deacetylase  36 
 
 		 307 aa  121  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1749  histone deacetylase superfamily protein  32.54 
 
 		 305 aa  121  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  31.45 
 
 		 341 aa  121  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 345 aa  121  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2387  histone deacetylase superfamily protein  35.74 
 
 		 317 aa  121  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3376  Histone deacetylase  35.11 
 
 		 317 aa  121  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  31.01 
 
 		 316 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0789  histone deacetylase superfamily  35.2 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  32.64 
 
 		 345 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  32.55 
 
 		 341 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  28.7 
 
 		 336 aa  119  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0919  hypothetical protein  35.2 
 
 		 307 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.457278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  32.21 
 
 		 369 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2528  histone deacetylase superfamily protein  33.96 
 
 		 315 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2247  histone deacetylase superfamily protein  35.06 
 
 		 307 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  33.21 
 
 		 334 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 		 336 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 365 aa  117  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  30.65 
 
 		 343 aa  116  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4170  histone deacetylase superfamily protein  35.27 
 
 		 307 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1514  putative histone deacetylase-family protein  34.27 
 
 		 334 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14124  normal  0.292905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>