More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  92.86 
 
 		 196 aa  360  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 199 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  59.07 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 198 aa  197  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 196 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  54.59 
 
 		 197 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  52.04 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  58.56 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 201 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 199 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  53.4 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  28.27 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  36.69 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.7 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
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NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
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NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  43.06 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
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