104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1563 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  100 
 
 
314 aa  613  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  54.63 
 
 
321 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  44.75 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  35.26 
 
 
312 aa  205  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  34.39 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  33.44 
 
 
315 aa  189  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  36.59 
 
 
315 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  33.86 
 
 
316 aa  185  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  32.55 
 
 
297 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
328 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.77 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25 
 
 
317 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.53 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.18 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.44 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.23 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  19.83 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.37 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.73 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.78 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  20.72 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.03 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.53 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  24.28 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.15 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.03 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  22.65 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  24.2 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  23.13 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  20.85 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.49 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.49 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.49 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  24.92 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.33 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.61 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.33 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  22.9 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.69 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  22.07 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
291 aa  53.1  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4929  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 
319 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
306 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  23.46 
 
 
328 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  21.47 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.83 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  21.89 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  21.89 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  21.99 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.21 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  21.65 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  24.4 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  23.35 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.1 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  24.48 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  21.93 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  25.93 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.26 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  22.29 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  21.59 
 
 
304 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.05 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.78 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  22.15 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  23.53 
 
 
305 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  23.61 
 
 
305 aa  45.8  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  21.99 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  24.45 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.16 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  22.41 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  21.58 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  23.78 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  22.37 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  21.63 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.03 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  24.13 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.3 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  22.59 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  21 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  22.59 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.45 
 
 
291 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.89 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  23.22 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  22.19 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  24.16 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>