286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0092 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  100 
 
 
282 aa  537  1e-152  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  62.81 
 
 
312 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  60.65 
 
 
293 aa  291  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  58.42 
 
 
290 aa  283  3e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  56.83 
 
 
308 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  57.4 
 
 
286 aa  272  5e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  52.71 
 
 
288 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  53.79 
 
 
292 aa  254  1e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  53.79 
 
 
292 aa  254  1e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  53.79 
 
 
292 aa  254  1e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  50.88 
 
 
298 aa  238  6e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  52.16 
 
 
300 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  55.2 
 
 
285 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  52.9 
 
 
298 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  51.23 
 
 
314 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.76 
 
 
562 aa  221  1e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  55.11 
 
 
312 aa  219  4e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  48.39 
 
 
325 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  51.24 
 
 
288 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  54.91 
 
 
311 aa  214  1e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  46.9 
 
 
555 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  45.24 
 
 
549 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  49.47 
 
 
539 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  48.24 
 
 
282 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.71 
 
 
539 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  47.52 
 
 
553 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  46.64 
 
 
288 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  46.79 
 
 
510 aa  197  1e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  48.29 
 
 
539 aa  197  1e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  44.37 
 
 
534 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  47.2 
 
 
536 aa  195  8e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  45.96 
 
 
531 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  44.41 
 
 
541 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.42 
 
 
585 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  45.34 
 
 
564 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.75 
 
 
518 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  41.91 
 
 
350 aa  184  2e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.2 
 
 
522 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  42.67 
 
 
350 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  43 
 
 
350 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  49.1 
 
 
285 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  42.47 
 
 
349 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  42.47 
 
 
348 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  45.81 
 
 
571 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  1.7266e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
359 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  42 
 
 
359 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
359 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  41.67 
 
 
355 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  41.67 
 
 
355 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  41.67 
 
 
355 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
371 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
371 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
371 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  42 
 
 
371 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.57 
 
 
309 aa  174  1e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  42.35 
 
 
310 aa  174  1e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  41.81 
 
 
356 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  41.47 
 
 
356 aa  173  3e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  42.19 
 
 
355 aa  173  3e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  41.67 
 
 
355 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.69 
 
 
339 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  41.34 
 
 
310 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  41.61 
 
 
353 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  38.51 
 
 
332 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  41.9 
 
 
339 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  44.13 
 
 
332 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  40.64 
 
 
309 aa  166  3e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  41.7 
 
 
335 aa  166  3e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  39.57 
 
 
316 aa  164  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.70574e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.57 
 
 
316 aa  164  1e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  3.09284e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.21 
 
 
316 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  41 
 
 
359 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  37.41 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  38.85 
 
 
310 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  38.85 
 
 
310 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  38.85 
 
 
310 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.45 
 
 
343 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.49 
 
 
310 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  38.49 
 
 
310 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 
310 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  38.49 
 
 
310 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 
310 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  38.49 
 
 
310 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  43.38 
 
 
592 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  39.87 
 
 
329 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.06 
 
 
314 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  38.13 
 
 
310 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 
323 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2812  allophanate hydrolase subunit 2  46.04 
 
 
302 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  38.01 
 
 
331 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  37.1 
 
 
309 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 
344 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  34.67 
 
 
328 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.8869e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.59 
 
 
310 aa  152  6e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.59 
 
 
310 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.59 
 
 
310 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.59 
 
 
310 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.59 
 
 
310 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.99 
 
 
323 aa  151  9e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  38.43 
 
 
336 aa  151  9e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>