More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5727 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
531 aa  1045    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  70.3 
 
 
553 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  67.71 
 
 
549 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  69.65 
 
 
539 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  59.32 
 
 
539 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  60.46 
 
 
534 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  57.97 
 
 
541 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  57.66 
 
 
536 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  51.89 
 
 
522 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  50.19 
 
 
562 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.6 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  49.18 
 
 
555 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.67 
 
 
539 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  50.23 
 
 
510 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.16 
 
 
585 aa  361  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  45.61 
 
 
564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  40.22 
 
 
592 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  40.56 
 
 
571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  35.62 
 
 
506 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.46 
 
 
290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  47.59 
 
 
308 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  56.72 
 
 
203 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  48.47 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  50 
 
 
293 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  35.05 
 
 
499 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  44.33 
 
 
286 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  56.37 
 
 
203 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  29.57 
 
 
549 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  53.23 
 
 
204 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  47.77 
 
 
298 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  42.32 
 
 
288 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  46.89 
 
 
311 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  52.94 
 
 
205 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.86 
 
 
285 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  55.67 
 
 
204 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  49.75 
 
 
201 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.71 
 
 
312 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  45.86 
 
 
285 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  51.26 
 
 
203 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  44.18 
 
 
288 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  47.23 
 
 
248 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  49.5 
 
 
235 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  45.39 
 
 
288 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  41.92 
 
 
292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  41.92 
 
 
292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  46.86 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  41.92 
 
 
292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  47.78 
 
 
221 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  47.78 
 
 
221 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  47.78 
 
 
221 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  39.93 
 
 
298 aa  170  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  48.58 
 
 
233 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  42.76 
 
 
282 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  48.26 
 
 
212 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  38.91 
 
 
300 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  49.48 
 
 
209 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  45.16 
 
 
219 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  48.5 
 
 
200 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  48.02 
 
 
203 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  39.48 
 
 
314 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  42.92 
 
 
218 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  38.38 
 
 
323 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  31.76 
 
 
306 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  34.33 
 
 
319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  52.38 
 
 
222 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  35.67 
 
 
307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  37.09 
 
 
317 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  44.29 
 
 
225 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  34.87 
 
 
348 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  34.87 
 
 
349 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.33 
 
 
229 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  40.89 
 
 
242 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.79 
 
 
310 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  31.25 
 
 
329 aa  145  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  32.76 
 
 
322 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.85 
 
 
343 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  35.52 
 
 
310 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  35.88 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  39.47 
 
 
244 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  39.91 
 
 
242 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  43.54 
 
 
215 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  43.26 
 
 
242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  41.63 
 
 
230 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  30.23 
 
 
334 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  40.89 
 
 
249 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  41.63 
 
 
227 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  36.55 
 
 
301 aa  140  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.35 
 
 
310 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.35 
 
 
310 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  41.92 
 
 
217 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.35 
 
 
310 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.35 
 
 
310 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.35 
 
 
310 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  37.42 
 
 
355 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.7 
 
 
354 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  32 
 
 
315 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  44.5 
 
 
225 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  30.77 
 
 
318 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  33.45 
 
 
304 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>