286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3556 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  71.07 
 
 		 286 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  61.9 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  57.86 
 
 		 290 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  56.07 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  53.79 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  56.83 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  50.18 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  50.18 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  50.18 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  55.24 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  47.35 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  48.42 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  53.25 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  49.83 
 
 		 553 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  48.58 
 
 		 325 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  46.93 
 
 		 555 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  52.63 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.02 
 
 		 549 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  46.82 
 
 		 562 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  53.76 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.3 
 
 		 285 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  47.59 
 
 		 531 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  50.16 
 
 		 539 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  49.31 
 
 		 539 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  49.3 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  43.33 
 
 		 539 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  51.59 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  48.25 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.23 
 
 		 585 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  44.48 
 
 		 510 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  44.25 
 
 		 541 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  45.74 
 
 		 564 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  45.21 
 
 		 536 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  45.45 
 
 		 571 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.77 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  41.78 
 
 		 534 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  42.36 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.84 
 
 		 522 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  46.98 
 
 		 518 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.55 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.93 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  43.86 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  45.82 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.8 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  37.99 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  37.37 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.81 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  34.83 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.3 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  40.62 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  41.4 
 
 		 335 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.76 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.94 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  35.88 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.88 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.94 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  41.24 
 
 		 354 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  39.79 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  40.07 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.59 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  40 
 
 		 349 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  38.62 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  39.26 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  41.18 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.02 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  40.21 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.88 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  39.73 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.52 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  38.8 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.52 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  40.88 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.41 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.13 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.13 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.97 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.8 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.17 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.17 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.17 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.17 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.17 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  42.34 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  37.25 
 
 		 359 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  32.88 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  38.83 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>