286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4802 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  100 
 
 
288 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  55.09 
 
 
290 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  52.04 
 
 
308 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  53.12 
 
 
286 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  52.58 
 
 
293 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  50.33 
 
 
555 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  49.65 
 
 
288 aa  228  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  52.7 
 
 
312 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  49.13 
 
 
288 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  47.37 
 
 
300 aa  222  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  52.26 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  45.4 
 
 
562 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  46.02 
 
 
298 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 
292 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.12 
 
 
285 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  47.37 
 
 
292 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 
292 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  46.62 
 
 
549 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  50.17 
 
 
553 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  49.14 
 
 
282 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  46.71 
 
 
314 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  45.21 
 
 
539 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  44.07 
 
 
325 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  51.24 
 
 
282 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.95 
 
 
539 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  49.48 
 
 
285 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  46.08 
 
 
531 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  48.25 
 
 
571 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  43 
 
 
534 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  44.44 
 
 
541 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  44.75 
 
 
536 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  47.78 
 
 
539 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  44.6 
 
 
510 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  44.4 
 
 
522 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  41.03 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  42.42 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.7 
 
 
312 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  44.62 
 
 
585 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  45.39 
 
 
518 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  46.83 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  36.99 
 
 
312 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 
309 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.98 
 
 
339 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  42.28 
 
 
564 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.99 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.99 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.99 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.55 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.99 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.81 
 
 
310 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.15 
 
 
314 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  43.64 
 
 
289 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  36.18 
 
 
311 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.15 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.82 
 
 
310 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  44.59 
 
 
592 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  37.75 
 
 
324 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.45 
 
 
310 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35.12 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.12 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 
310 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.12 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.12 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35.12 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.49 
 
 
310 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.83 
 
 
350 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  32.99 
 
 
307 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
320 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.15 
 
 
310 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.92 
 
 
330 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.67 
 
 
348 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.42 
 
 
324 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.51 
 
 
350 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.67 
 
 
349 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  32.99 
 
 
322 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37 
 
 
353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.54 
 
 
350 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  36.54 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 
329 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  38.7 
 
 
339 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 
315 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.33 
 
 
328 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  31.16 
 
 
334 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  38.69 
 
 
332 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
344 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.05 
 
 
343 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 
330 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.94 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.94 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  34.67 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  39.59 
 
 
359 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  37.11 
 
 
315 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>