286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0277 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  100 
 
 
292 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  82.88 
 
 
298 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  84.59 
 
 
314 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  76.82 
 
 
300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  52.67 
 
 
290 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  50.18 
 
 
308 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  50.88 
 
 
286 aa  248  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  48.94 
 
 
288 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  51.89 
 
 
312 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  49.12 
 
 
293 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  53.79 
 
 
282 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  47.55 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  48.06 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  48.44 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.9 
 
 
285 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  43.37 
 
 
562 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  46.67 
 
 
288 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  43.23 
 
 
555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  45.64 
 
 
549 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  45.95 
 
 
553 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  42.68 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  42.91 
 
 
539 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  42.96 
 
 
534 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  42.62 
 
 
539 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  46.29 
 
 
298 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  44.91 
 
 
311 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  46.81 
 
 
312 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  43.38 
 
 
539 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  43.09 
 
 
571 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  44.95 
 
 
592 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  42.56 
 
 
510 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 
536 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  43.85 
 
 
518 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  41.92 
 
 
531 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  40.41 
 
 
541 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.95 
 
 
310 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  40.57 
 
 
585 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.62 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  36.61 
 
 
309 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 
345 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  35.69 
 
 
312 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.8 
 
 
323 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  33.77 
 
 
328 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  38.99 
 
 
564 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  40.42 
 
 
522 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  35.84 
 
 
339 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  36.18 
 
 
335 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  35.49 
 
 
336 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  33.33 
 
 
549 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  35.15 
 
 
335 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 
309 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.07 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  35.76 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  37.04 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  37.58 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.57 
 
 
315 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.76 
 
 
309 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  33.45 
 
 
306 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  34.03 
 
 
311 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.69 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.69 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.69 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  33 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.37 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.37 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  35.92 
 
 
356 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  35.28 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  35.92 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  36.69 
 
 
355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35.92 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  36.55 
 
 
349 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  35.39 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  35.39 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35.92 
 
 
310 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  34.86 
 
 
316 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  33.56 
 
 
318 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.86 
 
 
316 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.95 
 
 
350 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  35.56 
 
 
310 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
343 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35.56 
 
 
310 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.56 
 
 
310 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.56 
 
 
310 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35.56 
 
 
310 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.56 
 
 
310 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  35.46 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.63 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.51 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.73 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  36.24 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  36.27 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>