More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3293 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  100 
 
 
536 aa  1064    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  58.63 
 
 
539 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  56.88 
 
 
549 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  58.64 
 
 
539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  57.22 
 
 
541 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  56.14 
 
 
534 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  57.09 
 
 
531 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  54.28 
 
 
553 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  53.21 
 
 
518 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  49.06 
 
 
522 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  45.69 
 
 
562 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  47.1 
 
 
539 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  45.22 
 
 
555 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.67 
 
 
585 aa  334  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  47.65 
 
 
510 aa  320  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  38.97 
 
 
592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  36.76 
 
 
564 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 
571 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  46.88 
 
 
290 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  45.45 
 
 
282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  43.75 
 
 
288 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  45.21 
 
 
286 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  47.42 
 
 
312 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  46.9 
 
 
293 aa  203  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  42.27 
 
 
285 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  52.71 
 
 
203 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  45.36 
 
 
308 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  51.47 
 
 
204 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.21 
 
 
549 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  44.22 
 
 
311 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  53.85 
 
 
204 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  47.69 
 
 
312 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.01 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  33.93 
 
 
499 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  43.88 
 
 
298 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  51.47 
 
 
203 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 
292 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  41.52 
 
 
292 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  48.53 
 
 
282 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  41.52 
 
 
292 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  42.21 
 
 
298 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  45.61 
 
 
288 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  44.37 
 
 
285 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  40.82 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  49.5 
 
 
205 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  37.62 
 
 
325 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  37.99 
 
 
300 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  42.03 
 
 
314 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  47.24 
 
 
201 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  47.24 
 
 
203 aa  170  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  44.64 
 
 
248 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  48.54 
 
 
212 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  48.53 
 
 
235 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  47.96 
 
 
233 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 
221 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 
221 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  45.96 
 
 
221 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  39.26 
 
 
349 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 
323 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  40.33 
 
 
334 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.72 
 
 
310 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.72 
 
 
310 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.72 
 
 
310 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.72 
 
 
310 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.72 
 
 
310 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 
349 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 
348 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.99 
 
 
353 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.72 
 
 
310 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.72 
 
 
310 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.72 
 
 
310 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  36.54 
 
 
310 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  36.54 
 
 
310 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  36.54 
 
 
310 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  36.54 
 
 
310 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.54 
 
 
310 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.01 
 
 
309 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
350 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  38.33 
 
 
354 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.33 
 
 
354 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.05 
 
 
350 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.78 
 
 
334 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.79 
 
 
345 aa  151  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  39.39 
 
 
339 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  37.29 
 
 
355 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  39 
 
 
310 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.96 
 
 
310 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  46.23 
 
 
200 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.39 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  37.92 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  40.07 
 
 
339 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  44.85 
 
 
209 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  38.38 
 
 
335 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0594  urea amidolyase related protein  38.21 
 
 
289 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.502162 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  35.67 
 
 
309 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.28 
 
 
335 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  33.78 
 
 
322 aa  143  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  37.67 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  32.9 
 
 
365 aa  141  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>