245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3557 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
205 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  65.83 
 
 
201 aa  254  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  57.92 
 
 
541 aa  226  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  57.43 
 
 
522 aa  224  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  60.4 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  55.02 
 
 
235 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  57.92 
 
 
204 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  56.65 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  52.71 
 
 
539 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  50.74 
 
 
539 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  52.94 
 
 
531 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  52.45 
 
 
518 aa  191  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  50.25 
 
 
553 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  50.24 
 
 
233 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  51.21 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  51.21 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  51.21 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  51.83 
 
 
562 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  52.45 
 
 
203 aa  185  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  52.91 
 
 
555 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  48.5 
 
 
248 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  46.77 
 
 
549 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  46.53 
 
 
534 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  53.23 
 
 
539 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  48.24 
 
 
212 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  49.75 
 
 
204 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  49.5 
 
 
536 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  47.47 
 
 
209 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  53.71 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  50.25 
 
 
200 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  49.71 
 
 
510 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  50.28 
 
 
219 aa  151  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  41.21 
 
 
217 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  42.34 
 
 
592 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  53.23 
 
 
571 aa  147  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  60.16 
 
 
564 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  48.98 
 
 
585 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  45.23 
 
 
203 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  47.98 
 
 
217 aa  141  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  44.5 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  39.71 
 
 
231 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  45.5 
 
 
218 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  46.11 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  47.4 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  46.99 
 
 
216 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  41.63 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  46.02 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  46.82 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  37.62 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  46.82 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  41.04 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  47.06 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  46.45 
 
 
216 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  45.11 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  52.03 
 
 
218 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  46.24 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  34.43 
 
 
229 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  41.18 
 
 
253 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  42.93 
 
 
506 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  52.03 
 
 
218 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  41.43 
 
 
225 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  41.63 
 
 
215 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  41.4 
 
 
218 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  42.37 
 
 
218 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  41.15 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  53.23 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  48.06 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  52.03 
 
 
247 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  29.77 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  41.85 
 
 
499 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  35.41 
 
 
215 aa  118  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
218 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 
258 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  40.47 
 
 
218 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  40.47 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  40.47 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  40.88 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  40.88 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  40.22 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  40.19 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  40.33 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  40.47 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  40.88 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  40.88 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  40.33 
 
 
218 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.63 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  39.8 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  39.8 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  39.78 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  34.41 
 
 
238 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  43.75 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  39.46 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  40.85 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>