More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0082 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  100 
 
 
539 aa  1018    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  48.13 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.68 
 
 
549 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.59 
 
 
518 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  49.35 
 
 
539 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  47.69 
 
 
553 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  47.1 
 
 
536 aa  389  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  45.64 
 
 
534 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  46.93 
 
 
531 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  43.68 
 
 
539 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  44.38 
 
 
562 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  45.7 
 
 
555 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  42.54 
 
 
522 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.57 
 
 
585 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  44.55 
 
 
510 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  42.81 
 
 
571 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  41.24 
 
 
592 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  42.12 
 
 
564 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  52.35 
 
 
312 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  52.2 
 
 
290 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  50.33 
 
 
308 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.91 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  48.04 
 
 
286 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  47.3 
 
 
288 aa  206  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34.23 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  45.18 
 
 
285 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  47.16 
 
 
293 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  46.69 
 
 
325 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  42.62 
 
 
292 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  42.62 
 
 
292 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  42.62 
 
 
292 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  51.47 
 
 
203 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  52.22 
 
 
203 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  47.6 
 
 
288 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  48.03 
 
 
282 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  43.21 
 
 
300 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  28.76 
 
 
549 aa  180  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  43.1 
 
 
298 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  43.92 
 
 
285 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  53.23 
 
 
205 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  49.26 
 
 
201 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  46.26 
 
 
288 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  49.75 
 
 
204 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  43.34 
 
 
339 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  43.96 
 
 
314 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  43.96 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  46.8 
 
 
204 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  43.99 
 
 
311 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  43.96 
 
 
298 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  43.24 
 
 
339 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  48.56 
 
 
203 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  44.81 
 
 
312 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  44.87 
 
 
248 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  40.14 
 
 
345 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  34.8 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.89 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  45.7 
 
 
235 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.49 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  38.89 
 
 
349 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  45.15 
 
 
233 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.49 
 
 
350 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  49.51 
 
 
209 aa  153  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  46.12 
 
 
221 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  46.12 
 
 
221 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  46.12 
 
 
221 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  35.46 
 
 
331 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.46 
 
 
335 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  32.3 
 
 
319 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.58 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  37.67 
 
 
339 aa  147  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  46.31 
 
 
205 aa  147  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.79 
 
 
350 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35 
 
 
310 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35 
 
 
310 aa  146  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.12 
 
 
343 aa  146  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35 
 
 
310 aa  146  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35 
 
 
310 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35 
 
 
310 aa  146  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  35 
 
 
310 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  35 
 
 
310 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.79 
 
 
314 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  35 
 
 
310 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  36.88 
 
 
310 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  35 
 
 
310 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  35.83 
 
 
314 aa  143  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  37.25 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  35.35 
 
 
326 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  36.08 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.84 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.84 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36.47 
 
 
356 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36.78 
 
 
356 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.36 
 
 
316 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  37.56 
 
 
242 aa  140  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
316 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  32.8 
 
 
329 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.32 
 
 
242 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>