269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1969 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  65.83 
 
 		 205 aa  254  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  59.9 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  59.2 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  54.9 
 
 		 522 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  57.5 
 
 		 203 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  51.24 
 
 		 541 aa  204  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  51.49 
 
 		 539 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  54.23 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  49.5 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  52.68 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  51.94 
 
 		 518 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  48.51 
 
 		 553 aa  191  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  49.75 
 
 		 531 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  47.52 
 
 		 549 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  50.99 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  50.99 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  50.99 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  49.5 
 
 		 539 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  51.49 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  48.76 
 
 		 534 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  48.48 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10268  hypothetical protein  47 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  49.26 
 
 		 539 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  47.4 
 
 		 555 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  47.24 
 
 		 536 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  48.72 
 
 		 562 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  44.3 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  49.49 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  55.69 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  50.87 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  45.21 
 
 		 592 aa  154  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  45.77 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  47.21 
 
 		 585 aa  150  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  46.29 
 
 		 510 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  44.28 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  46.01 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  46.23 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  49.7 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.65 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  53.97 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  44.55 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  49.11 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  49.11 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  43.93 
 
 		 564 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  46.39 
 
 		 571 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  46.75 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  44.93 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  46.12 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  46.12 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  39.71 
 
 		 240 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  51.18 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  42.05 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  42.11 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  45.89 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  45.89 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  42.11 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  53.6 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  44.97 
 
 		 216 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  45.98 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  42.38 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 256 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  42.38 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  42.65 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  42.38 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  42.38 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.38 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  41.62 
 
 		 218 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  39.56 
 
 		 242 aa  127  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  53.6 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  53.6 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  42.62 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  53.6 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  53.6 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  53.17 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  52.8 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  51.59 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  52 
 
 		 218 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  52 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  52 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  52 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  52 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  52 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  52 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  52 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  40.38 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  44.51 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  44.26 
 
 		 229 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  51.2 
 
 		 217 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.18 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  54.55 
 
 		 247 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  51.18 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  51.18 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  40.39 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  44.26 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  40 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>